动物前期广州包生男孩发育由存储在卵子中的母源因子(母源mRNA及母源蛋白)主导调控,在母源-合子转化(maternal-to-zygotictransition,MZT)时期,母源mRNA产生有序的降解,合子基因表达开端激活,逐步完结从母源主导到合子基因主导的过渡【1,2】。杨运桂/刘峰/麻锦彪协作研讨组的前期协作研讨提醒RNAm5C润饰经过其结合蛋白Ybx1招募Pabpc1a来保持一部分重要母源mRNA的稳定性,然后确保母源-合子转化正常进行(专家点评MolCell|杨运桂/刘峰/麻锦彪协作提醒RNAm5C润饰调控前期胚胎发育母源mRNA稳定性的机制)【3】。但是,前期胚胎发育中母源-合子转化的调控机制仍然存在着许多不知道。
近来,中国科学院北京基因组研讨所杨运桂研讨组、清华大学张强锋研讨组和中国科学院动物研讨所刘峰研讨组协作在GenomeBiology杂志上宣布了题为“RNAstructuraldynamicsregulateearlyembryogenesisthroughcontrollingtranscriptomefateandfunction”的研讨论文。
研讨团队经过小分子润饰结合深度测序的icSHAPE(invivoclickselective2’-hydroxylacylationandprofilingexperiment)【4】技能初次制作了斑马鱼前期胚胎发育中4碱基分辨率的RNA二级结构图谱,发现RNA结构在0h.p.f.(fertilizedegg)至6h.p.f.(shieldstage)之间出现高度动态性。进一步的剖析发现RNA结构动态区域富集了包括Elavl1a在内的很多母源-合子转化调控元件,提示RNA结构的动态改动在母源-合子转化历程中或许发挥必定效果。
研讨持续经过多组学剖析发现RNA结合蛋白Elavl1a或许以一种RNA结构依赖性的机制进行母源mRNA稳定性的调控。Elavl1aiCLIP数据和icSHAPE数据联合剖析显现Elavl1a倾向于结合单链RNA,体内/体外RNApulldown、凝胶阻滞试验(EMSA)也显现Elavl1a倾向于结合单链RNA。使用含有Elavl1amotif的不同结构探针的报告基因试验证明Elavl1a可经过结构依赖性的方法调控RNA稳定性。此外,基因功能试验显现Elavl1a缺失会导致斑马鱼胚胎发育缺点,标明Elavl1a对前期发育具有重要效果。胚胎发育初期,Elavl1a结兼并促进一些重要母源mRNA的稳定性,让这些母源因子能充沛发挥效果;跟着发育的进行,Elavl1a结合位点区域中RNA双链结构逐步构成并按捺Elavl1a的结合,然后有利于这些母源mRNA的降解。
图1.RNA二级结构经过Elavl1a调控mRNA稳定性示意图
综上所述,该作业初次制作了斑马鱼前期胚胎发育中4碱基分辨率的RNA二级结构图谱,并发现RNA二级结构动态性经过改动Elavl1a对mRNA的结合才能,从而调控母源mRNA稳定性,终究影响斑马鱼母源-合子转化及前期胚胎发育。此外,该作业在RNAm5C润饰研讨的基础上进一步标明RNA转录后调控在胚胎发育中具有重要效果。
1.TadrosWLipshitzHD(2009)Thematernal-to-zygotictransition:aplayintwoacts.Development136(18):3033-3042.
2.LeeMT,BonneauAR,GiraldezAJ(2014)Zygoticgenomeactivationduringthematernal-to-zygotictransition.AnnuRevCellDevBiol30:581-613.
3.YangY,etal.(2019)RNA5-MethylcytosineFacilitatestheMaternal-to-ZygoticTransitionbyPreventingMaternalmRNADecay.MolCell.
4.SpitaleRC,etal.(2015)StructuralimprintsinvivodecodeRNAregulatorymechanisms.Nature519(7544):486-490.
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